6月6日，清华大学发布消息称，为服务健康中国战略，完善一流大学布局，立足清华新百年学科建设与发展目标，清华大学拟建立医学部（本部），并将于6月10日（周五）举办仪式，以统筹规划清华大学医学事业的进一步发展。  清华大学官网信息显示，清华大学医学院成立于2001年10月25日，首任院长由中国著名医学科学家、两院院士吴阶平教授担任。生物物理学家赵南明教授，结构生物学家施一公院士，神经科学家鲁白教授，免疫学家董晨教授先后担任常务副院长。2016年9月，董晨教授担任医学院院长。  此前，2006年9月，根据清华大学和中国协和医科大学签署的《清华大学和中国协和医科大学关于落实两部协议的实施意见》，中国协和医科大学更名为北京协和医学院（清华大学医学部），英文名称为Peking Union Medical College, Tsinghua University。   2002年9月，教育部、卫生部两部领导曾签署了清华大学与中国协和医科大学紧密合作，共建“清华大学北京协和医学院”的协议，中国协和医科大学进入“211”和“985”工程建设项目。 按照教育部卫生部2007年协议，中国协和医科大学正式更名为“北京协和医学院”；鉴于与清华大学紧密合作办学的需要，同时使用“北京协和医学院—清华大学医学部”的名称。中国协和医科大学与清华大学合作办学，但两校并未合并。“北京协和医学院-清华大学医学部”中的“北京协和医学院”部分来自中国协和医科大学，北京协和医学院-清华大学医学部”中的“清华大学医学部”部分来自清华大学医学院。 北京协和医学院临床医学专业和非临床医学的学生研究生毕业证书及学位证书盖“清华大学”和“北京协和医学院-清华大学医学部”两个公章。